Q01.オープンシステム（分割発注方式）以外の方法での設計.監理の依頼はダメですか？

そんなことはありません。
オープンシステムを採用する事のメリットが大きいのでお勧めしています。
お客様の都合で一括発注を希望される場合は勿論可能です。